More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4529 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 311 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  95.82 
 
 		 310 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  89.42 
 
 		 312 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  90.06 
 
 		 312 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  90.06 
 
 		 312 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  88.75 
 
 		 307 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  85.21 
 
 		 303 aa  531  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  69.81 
 
 		 317 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  69.18 
 
 		 317 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  69.18 
 
 		 317 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  69.5 
 
 		 317 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  69.18 
 
 		 317 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  68.67 
 
 		 316 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  61.51 
 
 		 321 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  61.54 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  51.21 
 
 		 590 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  50.33 
 
 		 592 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  48.37 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  46.95 
 
 		 342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  46.95 
 
 		 342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  45.6 
 
 		 595 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  46.5 
 
 		 595 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  46.5 
 
 		 595 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  46.5 
 
 		 595 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  45.54 
 
 		 595 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  44.9 
 
 		 618 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  45.22 
 
 		 595 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  47.02 
 
 		 596 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  45.48 
 
 		 602 aa  254  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  45.25 
 
 		 596 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  45.25 
 
 		 596 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  45.25 
 
 		 596 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  45.03 
 
 		 602 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  47.87 
 
 		 590 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  45.61 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  45.02 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  45.67 
 
 		 568 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 602 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  44.69 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  39.78 
 
 		 345 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 		 588 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  37.79 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  33.11 
 
 		 750 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 		 592 aa  145  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  34.26 
 
 		 588 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  34.26 
 
 		 588 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  34.26 
 
 		 588 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 		 543 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  44.96 
 
 		 538 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  35.6 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  23.84 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.01 
 
 		 289 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 		 297 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  32.07 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  22.74 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 277 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  28.62 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  38.06 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  33.13 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.87 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  22.5 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  35.12 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.09 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  38.84 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.13 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>