More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3331 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 340 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  62.29 
 
 		 590 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  59.42 
 
 		 592 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  55.2 
 
 		 602 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  56.82 
 
 		 602 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  49.68 
 
 		 596 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  49.84 
 
 		 596 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  49.84 
 
 		 596 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  49.84 
 
 		 596 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  49.03 
 
 		 595 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  47.74 
 
 		 618 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  47.74 
 
 		 595 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  48.06 
 
 		 595 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  48.06 
 
 		 595 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  48.06 
 
 		 595 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  48.06 
 
 		 595 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  48.58 
 
 		 293 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  49.12 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  47.16 
 
 		 590 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  47.71 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  49.1 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  46.74 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  48.01 
 
 		 312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  48.01 
 
 		 312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  48.01 
 
 		 312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  48.01 
 
 		 303 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  48.01 
 
 		 311 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  47.65 
 
 		 310 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  47.97 
 
 		 316 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  46.1 
 
 		 316 aa  238  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  44.24 
 
 		 342 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  44.24 
 
 		 342 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  46.93 
 
 		 317 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  46.57 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  46.57 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  46.57 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  46.57 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  47.7 
 
 		 568 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 		 602 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 588 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  40.95 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  40.27 
 
 		 588 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  40.27 
 
 		 588 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  40.27 
 
 		 588 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 		 592 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  39.5 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  35.4 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  35.4 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  35.4 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  35.4 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  35.4 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  35.4 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  35.54 
 
 		 750 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  36.3 
 
 		 543 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  33.1 
 
 		 538 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 		 289 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  34.94 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  34.94 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  34.94 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  34.94 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  34.94 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  34.94 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  34.94 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 287 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  33.73 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  43.69 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  27.98 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.68 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.94 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  40.78 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  29.95 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  45.1 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  35.87 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  37.07 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  25.68 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  34.05 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>