More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4518 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 342 aa  685    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 342 aa  685    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  50.79 
 
 		 595 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  51.43 
 
 		 595 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  51.43 
 
 		 595 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  51.43 
 
 		 595 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  51.11 
 
 		 595 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  50.98 
 
 		 618 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  49.23 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  50.98 
 
 		 595 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  48.57 
 
 		 596 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  48.57 
 
 		 596 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  48.57 
 
 		 596 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  48.25 
 
 		 596 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  51.06 
 
 		 602 aa  278  9e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  49.36 
 
 		 602 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  48.75 
 
 		 321 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  48.03 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  48.03 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  48.03 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  48.03 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  48.51 
 
 		 312 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  48.03 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  48.51 
 
 		 312 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  48.51 
 
 		 312 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  48.47 
 
 		 311 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  48.57 
 
 		 316 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  48.68 
 
 		 316 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  48.18 
 
 		 303 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  47.8 
 
 		 307 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  48.95 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  43.75 
 
 		 592 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  44.24 
 
 		 340 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  43.56 
 
 		 590 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  43.25 
 
 		 293 aa  226  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 		 590 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  44.73 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 		 602 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 		 588 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  37 
 
 		 568 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  39.19 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 592 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  36.53 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 588 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 588 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 588 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 		 750 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 		 543 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 538 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.15 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.18 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.26 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  27.76 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.27 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 		 297 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  21.95 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 277 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  29.41 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  33.76 
 
 		 288 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  33.12 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  28.34 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  25.82 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  25.82 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  25.82 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  25.82 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  25.82 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  25.82 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  22.15 
 
 		 291 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>