More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2521 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
750 aa  1469    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
308 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  99.68 
 
 
308 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  99.68 
 
 
308 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  99.68 
 
 
308 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  99.68 
 
 
308 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  99.35 
 
 
308 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 
602 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 
602 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  40.33 
 
 
595 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  41.75 
 
 
595 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 
618 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 
595 aa  198  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  36.71 
 
 
590 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  37.54 
 
 
596 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  37.54 
 
 
596 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  37.54 
 
 
596 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
595 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
595 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
595 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  37.42 
 
 
596 aa  188  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  39.44 
 
 
315 aa  188  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  35.33 
 
 
592 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.46 
 
 
588 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 
340 aa  171  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 
320 aa  170  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  37.09 
 
 
590 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
293 aa  160  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 
602 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 
321 aa  153  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  34.8 
 
 
317 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  34.69 
 
 
345 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  34.8 
 
 
317 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  34.8 
 
 
317 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  34.8 
 
 
317 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  34.46 
 
 
317 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  35.14 
 
 
316 aa  151  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  36.54 
 
 
316 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  34.03 
 
 
307 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  34.03 
 
 
311 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 
310 aa  147  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
312 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
312 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
312 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
303 aa  144  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
342 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
342 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  35.67 
 
 
588 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  35.67 
 
 
588 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  35.67 
 
 
588 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  32.44 
 
 
592 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 
568 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
298 aa  122  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  39.26 
 
 
543 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 
281 aa  83.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
273 aa  79.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  28.72 
 
 
538 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  30.26 
 
 
349 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 
308 aa  76.6  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
303 aa  75.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
270 aa  73.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  30.26 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  30.26 
 
 
311 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  26.23 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
287 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  23.41 
 
 
289 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24 
 
 
289 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  29.81 
 
 
287 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 
290 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  30.26 
 
 
296 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  29.08 
 
 
296 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
289 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  30.26 
 
 
296 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  30.26 
 
 
296 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  30.26 
 
 
296 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
281 aa  69.7  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
288 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.97 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  28.44 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 
288 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
313 aa  67  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 
277 aa  66.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 
323 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  33.78 
 
 
288 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
293 aa  65.1  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 
287 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
300 aa  63.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  39.64 
 
 
322 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  34.42 
 
 
278 aa  63.9  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 
287 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.16 
 
 
294 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>