More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1006 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
317 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
317 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  99.68 
 
 
317 aa  634    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  100 
 
 
317 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  99.37 
 
 
317 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  92.74 
 
 
316 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  68.77 
 
 
311 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  68.45 
 
 
303 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  69.4 
 
 
307 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  68.14 
 
 
312 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  74.91 
 
 
310 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  68.14 
 
 
312 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  68.14 
 
 
312 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  63.33 
 
 
321 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  63.85 
 
 
316 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  52.54 
 
 
320 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  47.83 
 
 
595 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  47.83 
 
 
595 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  47.83 
 
 
595 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  46.89 
 
 
595 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  45.62 
 
 
590 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  47.3 
 
 
618 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  48.03 
 
 
342 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  48.03 
 
 
342 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  45.65 
 
 
595 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  47.3 
 
 
595 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  46.33 
 
 
596 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  48.11 
 
 
592 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  43.29 
 
 
596 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  43.29 
 
 
596 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  43.29 
 
 
596 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  47.45 
 
 
602 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 
602 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  47.7 
 
 
293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  46.57 
 
 
340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  45.58 
 
 
590 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  45.76 
 
 
568 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.1 
 
 
602 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  43.46 
 
 
315 aa  192  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
588 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  37.25 
 
 
345 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  34.8 
 
 
308 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  34.8 
 
 
308 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  34.8 
 
 
308 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  34.8 
 
 
308 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  34.8 
 
 
308 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  34.8 
 
 
308 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  34.8 
 
 
750 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
298 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 
592 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  37 
 
 
588 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  37 
 
 
588 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  37 
 
 
588 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  45.52 
 
 
543 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
301 aa  105  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
270 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  35.47 
 
 
538 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  36.63 
 
 
308 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  36.56 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
274 aa  90.1  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  33.54 
 
 
281 aa  86.3  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
287 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.59 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  34.48 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  33.1 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  33.1 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  33.1 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.2 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  33.1 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  33.1 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  36.31 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  33.1 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  33.1 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  38.19 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  34.73 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.37 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  28.27 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
293 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.33 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  39.61 
 
 
281 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
284 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
284 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  37.69 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  41.12 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  30.14 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  36.69 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>