More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0476 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  46.08 
 
 		 568 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  43.15 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  42.12 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 590 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 		 602 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  37.58 
 
 		 592 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 596 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 596 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 596 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 596 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 		 588 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  36.91 
 
 		 590 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  37.59 
 
 		 345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 		 595 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  39.62 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 		 595 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  40 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  38.17 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  36.53 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  39.78 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  36.53 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 		 595 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 		 595 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 		 595 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  35.84 
 
 		 618 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 		 602 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  38.85 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  35.62 
 
 		 595 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 		 602 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  32.44 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  32.41 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  32.41 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  32.41 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  32.64 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  32.41 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  33 
 
 		 750 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 		 588 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 		 588 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 		 588 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 		 592 aa  106  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  39.38 
 
 		 543 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 		 538 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.91 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  26.35 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  25.16 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  29.83 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  26.32 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  24.27 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  23.87 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  24.75 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  23.49 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>