More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2355 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
345 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 
592 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 
602 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  44.23 
 
 
602 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  41.31 
 
 
315 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 
590 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  41.24 
 
 
307 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 
312 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 
312 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  40.75 
 
 
568 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 
590 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 
320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  43.02 
 
 
595 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  38.01 
 
 
303 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 
311 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  40.98 
 
 
310 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 
293 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 
588 aa  179  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  42.64 
 
 
595 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  41.38 
 
 
596 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  41.38 
 
 
596 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  41.38 
 
 
596 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  42.64 
 
 
595 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  42.64 
 
 
595 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  42.64 
 
 
595 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
321 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  40.85 
 
 
316 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
602 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  41.09 
 
 
618 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 
596 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  41.31 
 
 
595 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 
342 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  39.19 
 
 
342 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  37.25 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  37.25 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  37.25 
 
 
317 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  37.25 
 
 
317 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  36.91 
 
 
316 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  37.25 
 
 
317 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  36.58 
 
 
298 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  33 
 
 
308 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  33 
 
 
308 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  33 
 
 
308 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  33 
 
 
308 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  33 
 
 
308 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  32.66 
 
 
308 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  34.69 
 
 
750 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 
588 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 
588 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 
588 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 
592 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  44 
 
 
543 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
538 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.84 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  26.35 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  29.69 
 
 
349 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 
293 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  30.99 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  30.99 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
274 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  30.69 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  30.69 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  30.69 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  30.69 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
289 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
289 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
287 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  33.13 
 
 
390 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  26.27 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 
288 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
288 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  24.56 
 
 
322 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
288 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  40.45 
 
 
290 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
288 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
300 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
306 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2350  hypothetical protein  38.55 
 
 
264 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000109829  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
287 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  30.81 
 
 
296 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>