More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1384 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 320 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  58.03 
 
 		 602 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  58.78 
 
 		 602 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  54.9 
 
 		 596 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  54.58 
 
 		 596 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  54.58 
 
 		 596 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  54.58 
 
 		 596 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  55.34 
 
 		 595 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  55.34 
 
 		 595 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  55.34 
 
 		 595 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  54.05 
 
 		 618 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  54.05 
 
 		 595 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  53.72 
 
 		 595 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  53.92 
 
 		 595 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  49.69 
 
 		 592 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  49.37 
 
 		 590 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  49.23 
 
 		 342 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  49.23 
 
 		 342 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  52.54 
 
 		 317 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  52.54 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  52.54 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  52.54 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  52.54 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  51.81 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 303 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  50.32 
 
 		 321 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  50 
 
 		 307 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  49.64 
 
 		 312 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  49.64 
 
 		 312 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  49.64 
 
 		 312 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  51.38 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  49.12 
 
 		 340 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  45.96 
 
 		 590 aa  246  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  49.11 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  48.96 
 
 		 315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  47.78 
 
 		 568 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 		 588 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 		 602 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  41.3 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  43.15 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 		 592 aa  178  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  39.02 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 		 588 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  39.02 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 		 588 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 		 588 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  39.02 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  39.02 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  39.02 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  39.02 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  39.02 
 
 		 750 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  37.07 
 
 		 543 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  35.03 
 
 		 538 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  38.2 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.84 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  34.71 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  35.81 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  33.5 
 
 		 341 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  38.18 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  38.36 
 
 		 277 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  33.89 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  29 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  33.5 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  33.5 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  38.76 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>