More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4339 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 588 aa  1187    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  45.86 
 
 		 590 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  45.17 
 
 		 592 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  43.37 
 
 		 602 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  43.2 
 
 		 602 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  42.29 
 
 		 590 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  44.41 
 
 		 595 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  43.3 
 
 		 596 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  43.3 
 
 		 596 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  43.3 
 
 		 596 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  43.32 
 
 		 596 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  44.06 
 
 		 595 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  44.41 
 
 		 595 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  44.41 
 
 		 595 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  43.89 
 
 		 618 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  44.41 
 
 		 595 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 		 595 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  42.12 
 
 		 592 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 		 588 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 		 588 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 		 588 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  42.61 
 
 		 568 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.24 
 
 		 602 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 		 543 aa  325  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3576  short chain dehydrogenase  38.75 
 
 		 538 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129186  normal  0.037556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  42.91 
 
 		 315 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  42.95 
 
 		 320 aa  212  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 		 340 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3548  alpha/beta hydrolase fold  38.11 
 
 		 293 aa  195  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1140  alpha/beta fold family hydrolase  37.7 
 
 		 308 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0689  alpha/beta fold family hydrolase  37.38 
 
 		 308 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2203  alpha/beta fold family hydrolase  37.38 
 
 		 308 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1296  alpha/beta fold family hydrolase  37.38 
 
 		 308 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1132  alpha/beta fold family hydrolase  37.38 
 
 		 308 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2091  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 		 308 aa  180  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2521  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 		 750 aa  180  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  35.84 
 
 		 342 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 		 342 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 		 345 aa  179  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  38.21 
 
 		 317 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  38.21 
 
 		 317 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  38.21 
 
 		 317 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  37.67 
 
 		 303 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  38.21 
 
 		 317 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  38.21 
 
 		 317 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 311 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1474  alpha/beta fold family hydrolase  37.88 
 
 		 316 aa  169  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 		 312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 		 312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  35.52 
 
 		 312 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  36.55 
 
 		 307 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  36.71 
 
 		 310 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0476  alpha/beta hydrolase fold protein  33.88 
 
 		 298 aa  157  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4876  alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 		 321 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000503768  normal  0.514103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1792  putative hydrolase  36.72 
 
 		 316 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000565691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 		 275 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 281 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 		 287 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2823  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 		 292 aa  140  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 		 309 aa  140  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 279 aa  139  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  36.58 
 
 		 265 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 271 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 285 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 285 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 278 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000841338  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 285 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 278 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 		 271 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 		 295 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 263 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 		 282 aa  130  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2034  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 290 aa  127  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 278 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 		 249 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 280 aa  126  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 274 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 274 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 		 280 aa  125  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 274 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 275 aa  124  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  36.55 
 
 		 292 aa  124  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 259 aa  123  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 		 290 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 		 277 aa  123  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 318 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 		 273 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 		 292 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  39.68 
 
 		 257 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 289 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.469183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  31.32 
 
 		 295 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 		 249 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 300 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 280 aa  121  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 267 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  35.5 
 
 		 269 aa  120  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 298 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.35 
 
 		 262 aa  120  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 		 308 aa  120  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>