More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1875 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.113929  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.12 
 
 		 305 aa  195  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 		 273 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659885 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.469183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  36.5 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  35.84 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  35.25 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  35.87 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  33.7 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  34.05 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  34.98 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  34.66 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  35.02 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  35.82 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.21 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  33.81 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  33.45 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  34.17 
 
 		 300 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  35.48 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  35.48 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  33.69 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  32.97 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  33.09 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  33.93 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  34.08 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  34.16 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 		 595 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 602 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 595 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 595 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  38.28 
 
 		 595 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 595 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 618 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 		 595 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 		 590 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 		 592 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 		 568 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 602 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 602 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 596 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 596 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 596 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 596 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  35.56 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 		 590 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  42.27 
 
 		 265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3851  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  35.29 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277606  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 279 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 		 295 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2823  short chain dehydrogenase  32.99 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  38.14 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  37.86 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.81 
 
 		 283 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  37.63 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.53 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066443  unclonable  0.000000222131 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.71 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  33.99 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  35.17 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.98 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  38.1 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  29.37 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 		 592 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>