More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1156 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 280 aa  555  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.8 
 
 		 280 aa  346  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  49.22 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.89 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 		 275 aa  192  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.28 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.48 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.48 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  37.79 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.931829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  38.27 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 286 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.561593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.11 
 
 		 184 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 		 280 aa  135  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  36.82 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  36.2 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0155651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 292 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 291 aa  128  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0300911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.16 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  35.41 
 
 		 595 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 245 aa  126  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  35.11 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  35.41 
 
 		 595 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.24 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  35.41 
 
 		 595 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.13 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.236721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1991  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 242 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 595 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 		 618 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 		 595 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  39.49 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 		 602 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 		 595 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.22 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  34.23 
 
 		 602 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11893  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.361469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 		 588 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142248  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.93 
 
 		 277 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 		 596 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 308 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 		 274 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 242 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 300 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 300 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  38.97 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 		 596 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 		 596 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.55 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>