More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1491 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 274 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.37 
 
 		 269 aa  288  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066443  unclonable  0.000000222131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1538  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  43.4 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0217494  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  40.07 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  41.26 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  40.07 
 
 		 300 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  43.77 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  39.58 
 
 		 300 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  39.22 
 
 		 300 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  38.77 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  38.38 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  39.18 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  38.46 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  37.54 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.01 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0728851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  36.79 
 
 		 301 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  39.25 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  35.54 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0863  hypothetical protein  33.08 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  36.27 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  36.27 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  36.43 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  36.43 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  38.38 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0894  hypothetical protein  31.95 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163818  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190304  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 273 aa  122  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.33 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3851  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  37.65 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277606  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 		 294 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 286 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.65 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.33 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 295 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  36.44 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  34.44 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0128402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  42.16 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  32.37 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 276 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  34.87 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 		 267 aa  112  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  34.6 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  34.32 
 
 		 568 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  29.58 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 		 595 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  33.82 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  37.5 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.113929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.6 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 		 289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.469183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  31.97 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.06 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 595 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 595 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 595 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>