More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11893 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11893  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 286 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.361469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.26 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.32 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  46.01 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  43.48 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  43.48 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  43.48 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  42.03 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2345  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190376  hitchhiker  0.00770319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3561  short chain dehydrogenase  42.64 
 
 		 276 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 		 297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.543752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 592 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  38.07 
 
 		 588 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 		 246 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  38.07 
 
 		 588 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  38.07 
 
 		 588 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  40.64 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 266 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 		 259 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  37.63 
 
 		 273 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 254 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.65 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 602 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  37.1 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0250  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.16 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.183431  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  32.56 
 
 		 595 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.506283  normal  0.100596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  33.63 
 
 		 259 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  37.43 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  38.5 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  34.74 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  37.7 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 		 274 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  31.4 
 
 		 618 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2157  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.26 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.817787  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  35.44 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  37.97 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  30.26 
 
 		 602 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 244 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  35.55 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 248 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  34.18 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  32.83 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  35.92 
 
 		 258 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0267  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3663  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6672  putative short-chain dehydrogenase/reductase  31.58 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  31.01 
 
 		 595 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  30.26 
 
 		 602 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  36.27 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.08 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  33.77 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  30.62 
 
 		 595 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  30.62 
 
 		 595 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.17 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>