More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3101 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
280 aa  559  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.59 
 
 
285 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
274 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
274 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.45 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
263 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 
298 aa  211  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  46.07 
 
 
265 aa  208  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.43 
 
 
279 aa  195  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.931829  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
280 aa  195  9e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.05 
 
 
277 aa  189  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  40.23 
 
 
273 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.48 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  39.45 
 
 
273 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
274 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
284 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.63 
 
 
272 aa  158  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
278 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.561593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.14 
 
 
184 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.81 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 
248 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
317 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
258 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 
282 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
280 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 
278 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
278 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  36.46 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 
248 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 
258 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 
248 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.45 
 
 
230 aa  136  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  32.53 
 
 
276 aa  136  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  37.5 
 
 
256 aa  135  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
256 aa  135  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 
249 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.88 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.79 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 
244 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
263 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  41.29 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
257 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 
240 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.54 
 
 
244 aa  132  6e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  43.16 
 
 
266 aa  132  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.97 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  30.11 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 
263 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.91 
 
 
258 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  37.73 
 
 
263 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  37.73 
 
 
263 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
260 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  37.73 
 
 
263 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  37.73 
 
 
263 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.33 
 
 
258 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
297 aa  129  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
249 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
245 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  37.33 
 
 
263 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
256 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.91 
 
 
258 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.89 
 
 
247 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0155651  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 
277 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0429275  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
245 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  37.33 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  37.27 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  37.33 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 
277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.48 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.94 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.94 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.48 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.94 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0453  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.36 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.94 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.48 
 
 
262 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
244 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
280 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
254 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
250 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  32.74 
 
 
275 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
238 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>