More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2397 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 280 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  32.32 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  37.5 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  32.58 
 
 		 273 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.931829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 		 278 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 		 184 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 		 602 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.47 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.47 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 		 307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  30.68 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 		 312 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 		 258 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 588 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 588 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  29.47 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 588 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.7 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  28.83 
 
 		 590 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 		 291 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.930868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  35.48 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  31.58 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  29.72 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  29.78 
 
 		 239 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2345  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190376  hitchhiker  0.00770319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 		 592 aa  105  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  29.39 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1790  short chain dehydrogenase  29.77 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.02 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  28.35 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1623  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.77 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000163996  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.76 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5592  short chain dehydrogenase  33.75 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.23191 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  28 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.99 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1917  short chain dehydrogenase  31.72 
 
 		 275 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5300  short chain dehydrogenase  33.75 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>