More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3214 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  100 
 
 
294 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  100 
 
 
294 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  100 
 
 
291 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12160  short chain dehydrogenase  68.15 
 
 
293 aa  407  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.223019  normal  0.712287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3477  short chain dehydrogenase  68.04 
 
 
292 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382288  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3050  short chain dehydrogenase  68.75 
 
 
295 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325921  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38260  short-chain alcohol dehydrogenase  46.92 
 
 
305 aa  209  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913124  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.9 
 
 
306 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1700  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 
301 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
306 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5212  short chain dehydrogenase  41.83 
 
 
348 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5592  short chain dehydrogenase  41.83 
 
 
348 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5300  short chain dehydrogenase  41.83 
 
 
348 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.11 
 
 
315 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
292 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 
309 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.35 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
289 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
275 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
275 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0358562  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.39 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  37.39 
 
 
281 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
268 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.48 
 
 
285 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 
254 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
278 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.33 
 
 
285 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.15 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.15 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.15 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
254 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
275 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.6 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
241 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0571  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.79 
 
 
245 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.653945  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
279 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
244 aa  112  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  41.62 
 
 
246 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
256 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  36.36 
 
 
276 aa  112  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0458  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.79 
 
 
245 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
244 aa  112  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.79 
 
 
245 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.82564  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
290 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
279 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
279 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
248 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.01 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  29.72 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.53 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.34 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0300911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
259 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 
269 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
264 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.86 
 
 
253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.895675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10628  short chain dehydrogenase  32.78 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 
269 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
254 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3704  ribitol 2-dehydrogenase  40.53 
 
 
242 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0194179  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
269 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0895  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.21 
 
 
245 aa  109  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0373369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
269 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 
252 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
269 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
242 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.432228  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  33.77 
 
 
257 aa  109  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
270 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>