More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2203 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 273 aa  564  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1917  short chain dehydrogenase  53.01 
 
 		 275 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  45.22 
 
 		 294 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  44.12 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  44.02 
 
 		 276 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  44.69 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  43.33 
 
 		 276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  45.99 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  45.39 
 
 		 269 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  45.62 
 
 		 270 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  45.39 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 		 295 aa  234  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  44.65 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  45.85 
 
 		 270 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 275 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  36.76 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  35.63 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  34.72 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  34.34 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  29.82 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  35.97 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  29.82 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  35.39 
 
 		 590 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 		 278 aa  142  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  35.83 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  39.57 
 
 		 253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  33.74 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  32.68 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0101774  normal  0.961149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 285 aa  135  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  32.03 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 		 588 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 		 588 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 		 588 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  33.47 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 		 568 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  30.68 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 		 280 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 596 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  39.57 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 		 596 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  32.54 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  31.54 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 		 596 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 		 596 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2823  short chain dehydrogenase  32.85 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  31.87 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.22 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 250 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 293 aa  128  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 602 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  31.08 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  32.16 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 184 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.24 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  31.47 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.55 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  35.75 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 602 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  33.98 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.88 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  33.73 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  33.73 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>