More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2100 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 249 aa  492  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000627  putative sorbitol-6-phosphate 2-dehydrogenase  45.82 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0213931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  38.37 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 253 aa  171  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  37.55 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 		 257 aa  168  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 249 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.11 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.11 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622704  normal  0.299827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  37.55 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  37.55 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  37.55 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  36.78 
 
 		 261 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.33 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  37.16 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  37.12 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  37.12 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  36.78 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  36.74 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  36.78 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.86 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  37.85 
 
 		 257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 		 276 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 265 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.78 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.85 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.33 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1022  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.522598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  35.25 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  36.88 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000760103 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.18 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 275 aa  148  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.240969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 269 aa  148  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 254 aa  148  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38962  normal  0.0399907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  38.62 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.388787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100274  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>