More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2561 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  78.67 
 
 
304 aa  494  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  76.67 
 
 
301 aa  475  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  75.25 
 
 
309 aa  475  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  76.67 
 
 
301 aa  475  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  74 
 
 
301 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  74.75 
 
 
301 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  72 
 
 
301 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  68.44 
 
 
305 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  65.89 
 
 
300 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  64.86 
 
 
300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  63.51 
 
 
300 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  63.51 
 
 
300 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  61.2 
 
 
300 aa  381  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  53.72 
 
 
292 aa  318  5e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  53.85 
 
 
300 aa  309  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  53.24 
 
 
289 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  52.46 
 
 
304 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  38.51 
 
 
298 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
285 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
310 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190304  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 
274 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  36.98 
 
 
295 aa  159  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
295 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
270 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
247 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
294 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  34.75 
 
 
270 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.76 
 
 
271 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 
269 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 
269 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  34.09 
 
 
271 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  35.97 
 
 
270 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
280 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
278 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4162  oxidoreductase  31.48 
 
 
284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
267 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 
590 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
273 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1538  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  35.36 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0217494  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  40.38 
 
 
596 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
310 aa  132  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.113929  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  30.47 
 
 
276 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3851  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  34.29 
 
 
277 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277606  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 
596 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 
596 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 
596 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 
568 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  40 
 
 
602 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 
595 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 
595 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 
595 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  37.29 
 
 
595 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.1 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  39.09 
 
 
602 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.659885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
283 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
595 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.61 
 
 
302 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.61 
 
 
302 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.61 
 
 
302 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.61 
 
 
302 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.61 
 
 
302 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  35.61 
 
 
302 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.61 
 
 
302 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.64 
 
 
273 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
283 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
271 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
288 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0728851  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
281 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
282 aa  122  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
602 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  32.68 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
618 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  29.22 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 
595 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
276 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  33.19 
 
 
276 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
305 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
286 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0128402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163818  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  31.5 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
276 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
276 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 
300 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 
300 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 
300 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>