More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3259 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.01 
 
 
278 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.49 
 
 
285 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.34 
 
 
275 aa  276  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
291 aa  246  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
267 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
278 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.4 
 
 
271 aa  175  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
270 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
270 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 
269 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
270 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
269 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 
295 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 
276 aa  158  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 
590 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  39.48 
 
 
602 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1917  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 
275 aa  142  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 
602 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  40.35 
 
 
596 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  40.35 
 
 
596 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  46.56 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  40.35 
 
 
596 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  38.28 
 
 
568 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  38.26 
 
 
595 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 
595 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  40.61 
 
 
596 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
595 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
595 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
595 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
602 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  36.74 
 
 
595 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 
275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  42.08 
 
 
588 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  42.08 
 
 
588 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  42.08 
 
 
588 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  37.12 
 
 
618 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  37.71 
 
 
592 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  30.96 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
282 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 
590 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.5 
 
 
255 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
252 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
263 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  39.8 
 
 
289 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  38.5 
 
 
295 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 
295 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  31.45 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  40.11 
 
 
592 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 
246 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0101774  normal  0.961149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  34.48 
 
 
276 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  29.64 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 
253 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.72 
 
 
264 aa  118  9e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
588 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
278 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000841338  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
275 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  33.72 
 
 
285 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  29.23 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  30.6 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  39.18 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  33.96 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
275 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  36.63 
 
 
300 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
300 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  40.98 
 
 
300 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
256 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  36.4 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  40.98 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2823  short chain dehydrogenase  31.72 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
246 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
246 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.94 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  31.67 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.98 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>