More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4610 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 278 aa  552  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.01 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.01 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.01 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.71 
 
 		 285 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.68 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.81 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.21 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 		 270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 269 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  39.5 
 
 		 595 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  39.5 
 
 		 595 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  39.5 
 
 		 595 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  40.83 
 
 		 602 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 		 595 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 		 595 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  41.05 
 
 		 602 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  40.69 
 
 		 590 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 		 618 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  41.23 
 
 		 596 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  40.96 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  37.99 
 
 		 595 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  40.69 
 
 		 596 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  40.69 
 
 		 596 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  40.69 
 
 		 596 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1917  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  43.65 
 
 		 588 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  43.65 
 
 		 588 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  43.65 
 
 		 588 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  39.09 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  38.93 
 
 		 568 aa  142  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  34.31 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  32.44 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  40.86 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 		 602 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  31.35 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  41.4 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  41.4 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 		 592 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  32.44 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 278 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 		 264 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 		 295 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  41.88 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  36.43 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  39.25 
 
 		 253 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  35.63 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 252 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  39.89 
 
 		 592 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  37.01 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 590 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  33.7 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 256 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  34.96 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  36.33 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 		 255 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  37.86 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  37.45 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  38.5 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  37.76 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  38.12 
 
 		 300 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 		 296 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 298 aa  118  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 268 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 		 588 aa  118  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000841338  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  35.45 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>