More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2430 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 285 aa  597  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  39.01 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  38.33 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  37.98 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  38.6 
 
 		 289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  37.28 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  37.06 
 
 		 300 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  36.59 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  34.84 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  35.54 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  34.8 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  33.45 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  34.01 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  34.62 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  34.48 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  34.49 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  34.49 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  33.45 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 		 294 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  33.94 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 274 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 275 aa  148  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.21 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  35.66 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  35.25 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  32.87 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066443  unclonable  0.000000222131 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1538  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  32.12 
 
 		 269 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0217494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 		 241 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3851  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  28.87 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.64 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  39.15 
 
 		 265 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 273 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0626824  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.36 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.36 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.36 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.36 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.36 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  35.53 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  34.36 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.36 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.03 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.03 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  35.03 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.36 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.113929  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  35.03 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  35.9 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 		 568 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  37.43 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  32.54 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  34.23 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  31.38 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 256 aa  122  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>