More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0417 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 247 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  39.19 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  39.19 
 
 		 301 aa  168  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  36.1 
 
 		 301 aa  161  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  36.82 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  35.77 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  36.33 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  35.61 
 
 		 300 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  35.77 
 
 		 304 aa  151  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  35.74 
 
 		 309 aa  150  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  39.32 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  34.17 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  35.04 
 
 		 301 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  35.04 
 
 		 301 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  34.89 
 
 		 300 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  34.67 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 		 282 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  34.53 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 602 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1538  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  38.61 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0217494  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  37.86 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  43.59 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0894  hypothetical protein  33.46 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0863  hypothetical protein  32.68 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 289 aa  135  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066443  unclonable  0.000000222131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  41.52 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.64 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 271 aa  128  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  41.58 
 
 		 568 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  36.65 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0728851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  38.54 
 
 		 294 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 		 590 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 290 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  45.36 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.7 
 
 		 271 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 588 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 588 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  34.82 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 		 588 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  36.49 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 		 276 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  34.33 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 		 275 aa  118  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  36.04 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  36.46 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 		 274 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 		 274 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 		 310 aa  115  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 277 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  34.36 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 295 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 		 592 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 		 595 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 		 595 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 		 595 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 		 595 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 		 595 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 283 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 		 296 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 		 289 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.469183 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3851  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  34.44 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277606  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 		 285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 602 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>