More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2042 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 329 aa  686    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  53.87 
 
 		 309 aa  345  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 		 308 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  31.58 
 
 		 311 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  36.72 
 
 		 306 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5601  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988839 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0982  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 308 aa  169  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0770  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 		 325 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  33.66 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 289 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0688  alpha/beta hydrolase fold protein  32.34 
 
 		 309 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0708  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  33.79 
 
 		 289 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 297 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  28.39 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  29.73 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 		 288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  29.93 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  24.16 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  25.23 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  25.41 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.31 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  25.5 
 
 		 294 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 		 304 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  24.11 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  23.85 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  23.38 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 308 aa  89.7  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  23.89 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  22.85 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  24.76 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 		 317 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 276 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  25.99 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  22.36 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  23.1 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  23.1 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  22.33 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  22.8 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  29.15 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  29.15 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  23.91 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  23.23 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  29.36 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  28.83 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  28.83 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  28.83 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>