More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2642 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 305 aa  613  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  65.87 
 
 		 299 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  62.46 
 
 		 293 aa  358  9e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  58.25 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  57.43 
 
 		 307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  58.76 
 
 		 305 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  55.7 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  59.79 
 
 		 296 aa  315  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  57.44 
 
 		 308 aa  309  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  54.92 
 
 		 305 aa  309  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  51.68 
 
 		 346 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  52.61 
 
 		 340 aa  295  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  52.22 
 
 		 347 aa  292  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  51.72 
 
 		 350 aa  291  8e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  51.71 
 
 		 345 aa  288  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  50.85 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  49.83 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  50.51 
 
 		 347 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  50.68 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  50.68 
 
 		 347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  51.43 
 
 		 341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  51.71 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  49.49 
 
 		 343 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  49.66 
 
 		 347 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  49.49 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  50.51 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  48.63 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  50.51 
 
 		 346 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  50.34 
 
 		 341 aa  279  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 349 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  53 
 
 		 349 aa  279  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  49.32 
 
 		 352 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  52.36 
 
 		 356 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  52.74 
 
 		 456 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  49.48 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  48.63 
 
 		 350 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  52.74 
 
 		 444 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  52.74 
 
 		 453 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  48.97 
 
 		 345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  51.03 
 
 		 347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  51.41 
 
 		 350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  46.26 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  44.18 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  46.6 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  48.63 
 
 		 364 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  48.63 
 
 		 350 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  48.59 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  48.47 
 
 		 348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  49.47 
 
 		 336 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  45.39 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  41.4 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  41.55 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  41.55 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  41.55 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  41.2 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  41.2 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  41.2 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  41.2 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  37.2 
 
 		 293 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 		 296 aa  205  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  40.42 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  40.07 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  41.55 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  41.55 
 
 		 296 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  41.28 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  41.44 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  33.49 
 
 		 287 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 291 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  30.13 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  29.73 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>