More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5733 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 288 aa  573  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  31.14 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  28.93 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  30.66 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.21 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  29.82 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 335 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 340 aa  92.4  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.35 
 
 		 346 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  28.04 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1705  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 321 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  33.95 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  33.49 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  29.68 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1843  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00347923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2627  alpha/beta hydrolase  27.01 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0771  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  29.14 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  20.56 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2119  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  28.27 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.57 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  23.59 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  22.6 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  22.6 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>