More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3187 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  87.67 
 
 		 293 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  71.58 
 
 		 639 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  63.64 
 
 		 284 aa  361  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  60.71 
 
 		 290 aa  353  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  59.29 
 
 		 284 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  58.51 
 
 		 281 aa  346  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  59.22 
 
 		 284 aa  346  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  58.89 
 
 		 297 aa  346  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  57.14 
 
 		 283 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  55.94 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  58.36 
 
 		 289 aa  330  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  55.05 
 
 		 336 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  55.56 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  53.95 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  55.52 
 
 		 323 aa  319  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  57.04 
 
 		 296 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  51.85 
 
 		 296 aa  315  7e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  54.2 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  52.92 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  54.23 
 
 		 321 aa  311  7.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  51.18 
 
 		 296 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  53.19 
 
 		 323 aa  301  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  52.3 
 
 		 337 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  49.12 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  52.61 
 
 		 300 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  47.04 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  49.28 
 
 		 296 aa  279  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  50.18 
 
 		 289 aa  278  9e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  47.89 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  46.83 
 
 		 324 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  47.87 
 
 		 294 aa  275  9e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  47.89 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  45.83 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  47.86 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  47.4 
 
 		 296 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  45.07 
 
 		 315 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  43.3 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  48.74 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  46.71 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 301 aa  262  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  50.18 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  49.82 
 
 		 290 aa  255  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  41.64 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  48.41 
 
 		 291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  47.08 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  47.08 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  47.08 
 
 		 290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  48.21 
 
 		 305 aa  241  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  43.06 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  43.01 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  44.29 
 
 		 290 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  41.16 
 
 		 297 aa  208  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  40.48 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  39.86 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  36.46 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  78.35 
 
 		 99 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  48.65 
 
 		 409 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  29.57 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 282 aa  92.8  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  27.78 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  28.16 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  36.64 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  28.04 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  34.1 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  39.34 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  27.22 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  27.22 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  27.22 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  27.53 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  33.58 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  32.02 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  25.44 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  32.02 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  25.34 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  32.02 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  35.12 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 339 aa  79  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>