More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3479 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 296 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  92.91 
 
 		 296 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  74.05 
 
 		 323 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  69.47 
 
 		 308 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  58.51 
 
 		 284 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  57.53 
 
 		 297 aa  355  5.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  59.64 
 
 		 283 aa  351  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  59.07 
 
 		 289 aa  350  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  58.72 
 
 		 284 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  56.58 
 
 		 284 aa  345  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  57.3 
 
 		 281 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  56.88 
 
 		 356 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  54.61 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  54.84 
 
 		 290 aa  328  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  53.33 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  53.47 
 
 		 336 aa  322  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.39 
 
 		 639 aa  322  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  52.08 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  52.07 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  51.18 
 
 		 293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 323 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  52.05 
 
 		 321 aa  305  5.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  50.88 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  48.8 
 
 		 321 aa  295  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  49.65 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  48.41 
 
 		 324 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  48.41 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  48.1 
 
 		 303 aa  285  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  45.52 
 
 		 300 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  46.71 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  44.71 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  48.24 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  48.24 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  48.24 
 
 		 290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  47.2 
 
 		 294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  47.37 
 
 		 290 aa  269  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  43.31 
 
 		 315 aa  266  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  48.96 
 
 		 291 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  47.89 
 
 		 287 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  45.99 
 
 		 289 aa  261  8.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  43.84 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  42.65 
 
 		 283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  43.54 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  43.11 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  43.49 
 
 		 323 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  43.9 
 
 		 309 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  41.95 
 
 		 300 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  41.78 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  44.25 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  39.02 
 
 		 335 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 		 303 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  39.1 
 
 		 305 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  38.97 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  36.52 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 		 297 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  46.97 
 
 		 409 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  57.29 
 
 		 99 aa  119  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  27.7 
 
 		 298 aa  92.4  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  26.87 
 
 		 314 aa  92  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 301 aa  89  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  23.25 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  26.44 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  23.42 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  38.94 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  22.79 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  39.83 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  42.45 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  34.19 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>