More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39941 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  100 
 
 		 313 aa  636    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  43.58 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  43.48 
 
 		 284 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  40.75 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  42.09 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  41.02 
 
 		 284 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  39.06 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  39.61 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  39.48 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  41.13 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  37.34 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  37.28 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  39.53 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  39.59 
 
 		 324 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  38.95 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.75 
 
 		 639 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  40.7 
 
 		 329 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  39.06 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  37.94 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  36.93 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  39.31 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  40.48 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  39.87 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  37.88 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  36.36 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  39.07 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  36.95 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  38.03 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  35.95 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.92 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  36.52 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  38.06 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  36.46 
 
 		 301 aa  189  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  37.54 
 
 		 288 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  36.01 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  34.46 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  35.15 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  35.15 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  35.15 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  33.89 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 296 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 297 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  40 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  40.45 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  28.45 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  23.49 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  22.59 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  28.7 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  21.24 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  21.95 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  21.45 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  28.21 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  29.75 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  20.57 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  21.94 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  29.77 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  22.54 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  27.56 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  21.31 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  27.56 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.56 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  27.56 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  27.56 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  27.56 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1797  alpha/beta hydrolase fold  24.84 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696369  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  24.31 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  23.84 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>