More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7174 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
284 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  83.33 
 
 
284 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  83.69 
 
 
284 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  77.3 
 
 
281 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  77.66 
 
 
283 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  73.31 
 
 
290 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  65.12 
 
 
297 aa  381  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  65.93 
 
 
289 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  60.14 
 
 
336 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  60.71 
 
 
336 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  60.43 
 
 
308 aa  364  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  60.5 
 
 
334 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  58.87 
 
 
296 aa  358  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  58.51 
 
 
296 aa  357  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  60.28 
 
 
639 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  57.91 
 
 
356 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  59.22 
 
 
296 aa  348  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  59.29 
 
 
293 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  58.01 
 
 
323 aa  344  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  56.94 
 
 
311 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  56.74 
 
 
321 aa  339  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  57.86 
 
 
293 aa  338  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  55.16 
 
 
329 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  57.19 
 
 
323 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  55.52 
 
 
321 aa  329  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  55.36 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  51.79 
 
 
324 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  49.51 
 
 
315 aa  314  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  51.08 
 
 
300 aa  310  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  54.42 
 
 
294 aa  308  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  53.71 
 
 
296 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  52.19 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  48.93 
 
 
323 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  53 
 
 
300 aa  298  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  53 
 
 
290 aa  298  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  49.82 
 
 
283 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  52.8 
 
 
289 aa  296  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  48.07 
 
 
303 aa  295  8e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  48.24 
 
 
306 aa  290  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  51.41 
 
 
287 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  50.7 
 
 
309 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  51.27 
 
 
374 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  49.3 
 
 
290 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  51.76 
 
 
293 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  49.3 
 
 
290 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  49.3 
 
 
290 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  46.79 
 
 
301 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  45.61 
 
 
323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  46.45 
 
 
288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  49.65 
 
 
291 aa  265  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  47.22 
 
 
305 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  42.55 
 
 
303 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  43.48 
 
 
313 aa  235  6e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  39.29 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 
290 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  41.49 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  40.14 
 
 
289 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  39.22 
 
 
297 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
297 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  50 
 
 
409 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  68.13 
 
 
99 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
275 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  29.93 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  41.46 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  41.46 
 
 
302 aa  93.6  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 
267 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  30.77 
 
 
298 aa  89.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
282 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  30 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3408  hypothetical protein  52 
 
 
80 aa  85.5  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337254  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  27.37 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  25.53 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  23.96 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  40.74 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  35.48 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  35.48 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  35.48 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  35.48 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  35.48 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  35.48 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  35.48 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>