More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2688 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  79.15 
 
 		 283 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  77.82 
 
 		 284 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  77.3 
 
 		 284 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  75 
 
 		 284 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  69.64 
 
 		 290 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  63.35 
 
 		 297 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  63.21 
 
 		 289 aa  368  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  60.28 
 
 		 296 aa  355  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  57.65 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  56.54 
 
 		 336 aa  349  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  58.51 
 
 		 293 aa  346  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  57.65 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.57 
 
 		 639 aa  340  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  57.35 
 
 		 308 aa  338  7e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  55.96 
 
 		 356 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  56.23 
 
 		 296 aa  335  5.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  57.3 
 
 		 296 aa  335  5.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  55.48 
 
 		 311 aa  334  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  56.38 
 
 		 293 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  56.63 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  55.48 
 
 		 323 aa  318  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  54.04 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  54.8 
 
 		 329 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  53.55 
 
 		 337 aa  311  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  53.36 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  51.6 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  49.11 
 
 		 300 aa  291  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  51.99 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  48.42 
 
 		 303 aa  285  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  48.55 
 
 		 296 aa  285  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  47.39 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  50.18 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 289 aa  282  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 		 294 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  47.37 
 
 		 306 aa  281  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  49.28 
 
 		 323 aa  280  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  49.82 
 
 		 290 aa  276  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  50.35 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  46.95 
 
 		 283 aa  275  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  48.42 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  46.13 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  47.02 
 
 		 290 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  47.02 
 
 		 290 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  47.02 
 
 		 290 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  46.85 
 
 		 309 aa  258  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  46.43 
 
 		 323 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 		 288 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  46.15 
 
 		 293 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  46.64 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  45.52 
 
 		 305 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  42.09 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  39.15 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  40.64 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  39.79 
 
 		 289 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  39.16 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  64.52 
 
 		 99 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  44.7 
 
 		 409 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 275 aa  92.4  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  39.32 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3408  hypothetical protein  54.93 
 
 		 80 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  37.72 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  29.17 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2691  Microsomal epoxide hydrolase  38.46 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1066  epocide hydrolase domain-containing protein  38.53 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  39.67 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  27.92 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  36.36 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  35.83 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3479  epoxide hydrolase-like  33.81 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827905 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  33.33 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  27.3 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  36.44 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>