More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0178 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
323 aa  660    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  74.05 
 
 
296 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  73.68 
 
 
296 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  70.07 
 
 
308 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  61.79 
 
 
297 aa  362  5.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  57.65 
 
 
283 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  58.01 
 
 
284 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  58.42 
 
 
284 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  60.81 
 
 
289 aa  341  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  56.01 
 
 
296 aa  335  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  56.27 
 
 
284 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  56.99 
 
 
290 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  56.63 
 
 
281 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.49 
 
 
639 aa  332  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  53.18 
 
 
336 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  53.9 
 
 
356 aa  322  7e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  54.36 
 
 
293 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  52.17 
 
 
336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  55.52 
 
 
293 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  54.58 
 
 
334 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  53.45 
 
 
323 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  53.79 
 
 
311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  50.33 
 
 
321 aa  300  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  47.57 
 
 
324 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  50.7 
 
 
321 aa  296  3e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  51.25 
 
 
374 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
337 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  47.97 
 
 
294 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  45.85 
 
 
296 aa  275  7e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 
303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  46.24 
 
 
300 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  44.41 
 
 
323 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 
287 aa  270  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  48.78 
 
 
290 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  48.41 
 
 
290 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  42.81 
 
 
323 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  48.41 
 
 
290 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  48.41 
 
 
290 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  43.09 
 
 
315 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  47.45 
 
 
289 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  42.66 
 
 
301 aa  259  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  49.47 
 
 
291 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  42.65 
 
 
283 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  46.21 
 
 
300 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  42.81 
 
 
306 aa  252  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  45.39 
 
 
296 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  47.87 
 
 
293 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 
288 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 
309 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 
335 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  39.16 
 
 
305 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  41.46 
 
 
297 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 
303 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  36.36 
 
 
313 aa  202  6e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  36.88 
 
 
289 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
290 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 
296 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 
297 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  48.46 
 
 
409 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  62.92 
 
 
99 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
290 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  24.46 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  30.53 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 
298 aa  89.7  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  27.92 
 
 
306 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  27.46 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  27.21 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.54 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  26.71 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  24.56 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  24.82 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  27.97 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  22.89 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  41.53 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  27.08 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  34.72 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>