More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2769 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 305 aa  610  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  47.22 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  47.22 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  46.21 
 
 		 323 aa  242  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  48.21 
 
 		 293 aa  241  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  45.49 
 
 		 296 aa  242  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  46.5 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  46.88 
 
 		 284 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.04 
 
 		 639 aa  239  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  41.26 
 
 		 321 aa  235  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  43.97 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  45.89 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  45.52 
 
 		 281 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  41.11 
 
 		 308 aa  231  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  46.62 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  42.71 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  43.66 
 
 		 289 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  44.13 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  44.72 
 
 		 289 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  41.05 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  41.36 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  43.66 
 
 		 336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 		 336 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  42.36 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  42.25 
 
 		 289 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  40.64 
 
 		 329 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  43.31 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  42.31 
 
 		 334 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  42.65 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  39.3 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  39.1 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  42.52 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  41.81 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  39.16 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  40.21 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.61 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  40.41 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  38.25 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  36.77 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  39.12 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  35.17 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  38.73 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  39.22 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  37.75 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  34.86 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  42.05 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  41.13 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  33.57 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  29.29 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 335 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  41.73 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  28.81 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  29.29 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  28.62 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  28.07 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  25.16 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  28.93 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  24.66 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  46.24 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  27.5 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.08 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  27.46 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>