More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1743 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 318 aa  667    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  93.4 
 
 		 339 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  93.08 
 
 		 339 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  93.08 
 
 		 320 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  93.56 
 
 		 302 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  93.22 
 
 		 302 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  93.56 
 
 		 302 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  93.22 
 
 		 302 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  88.37 
 
 		 303 aa  568  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  85.96 
 
 		 301 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  86.16 
 
 		 295 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  82.49 
 
 		 297 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  82.82 
 
 		 291 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  80.28 
 
 		 290 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  77.1 
 
 		 297 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  76.71 
 
 		 308 aa  488  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  76.21 
 
 		 293 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  68.37 
 
 		 310 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  64.21 
 
 		 294 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  64.34 
 
 		 300 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  63.86 
 
 		 300 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  63.86 
 
 		 298 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  60.84 
 
 		 296 aa  381  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  52.46 
 
 		 296 aa  317  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  52.13 
 
 		 294 aa  314  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  51.72 
 
 		 300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  48.95 
 
 		 301 aa  288  8e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  48.6 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  46.9 
 
 		 296 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  46.34 
 
 		 299 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  44.25 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  39.66 
 
 		 314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 304 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 304 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 861 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  33.33 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  33.33 
 
 		 302 aa  136  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.86 
 
 		 922 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 		 875 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.91 
 
 		 978 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 		 927 aa  125  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  28.01 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.07 
 
 		 922 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.65 
 
 		 899 aa  119  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 299 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 		 915 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  28.38 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  29.97 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  29.17 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  28.47 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  29.68 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  29.68 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  29.68 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  28.72 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 329 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  27.99 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  27.72 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 309 aa  99.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 321 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 323 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  25.75 
 
 		 330 aa  99.4  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  39.39 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  25.41 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 291 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  27.24 
 
 		 298 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  42.72 
 
 		 301 aa  95.9  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  28.57 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  38.76 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  27.3 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.6 
 
 		 334 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  24.6 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.34 
 
 		 461 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  27.8 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>