More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03953 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  100 
 
 		 300 aa  619  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  78.45 
 
 		 296 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  71.43 
 
 		 301 aa  447  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  71.1 
 
 		 301 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  50.85 
 
 		 301 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  51.35 
 
 		 297 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  53.17 
 
 		 297 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  52.07 
 
 		 339 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  51.01 
 
 		 295 aa  305  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  52.07 
 
 		 339 aa  305  6e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  52.07 
 
 		 320 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  51.72 
 
 		 318 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  51.41 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  52.07 
 
 		 302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  52.07 
 
 		 302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  51.59 
 
 		 290 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  52.07 
 
 		 302 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  50.51 
 
 		 293 aa  302  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  52.07 
 
 		 302 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  52.9 
 
 		 294 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  52.07 
 
 		 303 aa  299  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  51.54 
 
 		 296 aa  295  7e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  51.03 
 
 		 308 aa  295  8e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  50.51 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  50.68 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 		 300 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  48.65 
 
 		 298 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  49.31 
 
 		 294 aa  275  9e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  47.6 
 
 		 296 aa  271  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  46.55 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  41.36 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  33.68 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 861 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 927 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.19 
 
 		 899 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 875 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  30.84 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.11 
 
 		 922 aa  119  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  30.6 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  33.33 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.66 
 
 		 922 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.73 
 
 		 978 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  30.42 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  32.37 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  33.33 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  31.76 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  30.79 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  29.77 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  29.25 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  30.34 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  24.83 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  24.83 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  26.37 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 323 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  29.7 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 915 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  33.03 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  28.53 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 337 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 324 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  31.51 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  27.3 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  28.39 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  28.39 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  28.39 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  29.15 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  25.25 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  24.51 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  30.1 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0534  alpha/beta hydrolase fold protein  32.01 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  29.93 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  24.68 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  25.54 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  49.46 
 
 		 118 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>