More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3235 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  100 
 
 
301 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  97.31 
 
 
299 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  90.91 
 
 
309 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  75.96 
 
 
302 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  67.72 
 
 
293 aa  358  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  57.5 
 
 
296 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  54.7 
 
 
295 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  57.35 
 
 
296 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  55.67 
 
 
304 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  56.68 
 
 
301 aa  295  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  54.24 
 
 
327 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  51.69 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  54.06 
 
 
338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  54.61 
 
 
303 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  54.7 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  51.72 
 
 
330 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  50.87 
 
 
310 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  46.62 
 
 
302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  43.84 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  44.88 
 
 
288 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  44.88 
 
 
288 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  42.76 
 
 
290 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
346 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
339 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 
316 aa  90.9  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
287 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 
340 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  31.34 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
312 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
268 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  26.32 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.12 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.32 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  29.12 
 
 
356 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  41.9 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.31 
 
 
639 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  28.93 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  40.95 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  40.95 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.36 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  40 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  28.21 
 
 
453 aa  72.8  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.34 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  36.44 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  22.38 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  29.2 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.49 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>