More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2886 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 290 aa  586  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  65.96 
 
 		 303 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  67.38 
 
 		 289 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  67.02 
 
 		 296 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  44.95 
 
 		 337 aa  251  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  43.6 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  44.64 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  45.1 
 
 		 296 aa  245  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  43.11 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  42.41 
 
 		 336 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  42.61 
 
 		 329 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  41.64 
 
 		 336 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  42.86 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.81 
 
 		 639 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  41.96 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  41.2 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 		 284 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  42.7 
 
 		 290 aa  224  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  41.05 
 
 		 303 aa  224  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  44.29 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  44.93 
 
 		 293 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  43.01 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  42.25 
 
 		 311 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  41.1 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  38.75 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  42.36 
 
 		 289 aa  220  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  42.36 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  39.79 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  38.73 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  41.96 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  39.49 
 
 		 356 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  41.55 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  38.3 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  38.33 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  38.33 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  41.58 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  39.15 
 
 		 283 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  37.06 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  40.14 
 
 		 297 aa  195  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 315 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 290 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 290 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 290 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 		 283 aa  191  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  35.82 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.68 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  40.96 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  27.06 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  35.52 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 		 267 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.13 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 346 aa  89.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 		 288 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 339 aa  89.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  28.14 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 339 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  42.62 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  28.73 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 339 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  38.66 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>