More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5957 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
296 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  88.93 
 
 
289 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  67.02 
 
 
290 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  60.69 
 
 
303 aa  353  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  44.37 
 
 
337 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  43.84 
 
 
323 aa  234  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  43.71 
 
 
321 aa  231  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  42.61 
 
 
336 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  41.61 
 
 
324 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  42.36 
 
 
329 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  42.21 
 
 
336 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  43.16 
 
 
334 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  43.97 
 
 
296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.25 
 
 
639 aa  215  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  41.49 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  43.31 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  41.4 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  38.85 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  40.66 
 
 
356 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 
311 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  40.99 
 
 
283 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
290 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  42.09 
 
 
293 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  40.35 
 
 
289 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  39.86 
 
 
284 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  39.01 
 
 
300 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  40.96 
 
 
300 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 
309 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 
293 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  39.51 
 
 
284 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  39.39 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  37.2 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  40.14 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  39.1 
 
 
287 aa  198  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  39.1 
 
 
289 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  37.2 
 
 
306 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 
293 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  39.1 
 
 
323 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  36.05 
 
 
296 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.58 
 
 
290 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  38.11 
 
 
294 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  37.06 
 
 
323 aa  189  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  39.07 
 
 
296 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  39.66 
 
 
297 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  36.52 
 
 
296 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  36.08 
 
 
323 aa  186  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  37.33 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  37.33 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  37.33 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 
374 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  38.25 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 
335 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  29.67 
 
 
313 aa  158  9e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 
288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
297 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  40.28 
 
 
409 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
275 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
282 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  28.47 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
339 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
295 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  27.63 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  40.87 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  40.87 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.28 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1797  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696369  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  24.84 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  26.81 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  26.37 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
302 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  38.26 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  41.49 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  26.25 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.41 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>