More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0348 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  100 
 
 		 322 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  72.73 
 
 		 327 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  71.14 
 
 		 338 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  72.82 
 
 		 330 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  60.35 
 
 		 296 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  59.3 
 
 		 295 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  59.23 
 
 		 296 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  58.19 
 
 		 304 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  56.41 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  50.85 
 
 		 384 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  54.7 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  54.3 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  54.42 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  54.33 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  54.36 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  51.27 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  48.49 
 
 		 310 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  41.96 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  42.25 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  41.3 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  40.14 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 287 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  28.97 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 278 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 		 333 aa  92.8  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 287 aa  90.1  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  23.34 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  27.48 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  28.09 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  40.57 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 		 269 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  29.47 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  38.52 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  39.62 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  39.62 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  41.88 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  40.5 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  22.26 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  22.18 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  38.68 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  26.17 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 279 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  25.34 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  35.39 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>