More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3199 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  100 
 
 		 309 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  89.83 
 
 		 301 aa  521  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  90.44 
 
 		 299 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  75.26 
 
 		 302 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  66.19 
 
 		 293 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  56.79 
 
 		 296 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  56.99 
 
 		 296 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  54.96 
 
 		 304 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  54.88 
 
 		 384 aa  299  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  57.4 
 
 		 301 aa  298  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  54.12 
 
 		 295 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  53.42 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  54.77 
 
 		 338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  54.36 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  53.29 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  50.88 
 
 		 330 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  50.51 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  46.4 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  44.2 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  45.77 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  45.77 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  43.66 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.42 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.74 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.25 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  26.47 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  30.25 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  30.12 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  30.07 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  28.12 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  29.29 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  22.79 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  26.48 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2167  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  25.6 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  25.6 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  25.6 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  29.01 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.37 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  29.69 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.72 
 
 		 639 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  28.57 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>