More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0487 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 310 aa  626  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  51.19 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1260  alpha/beta hydrolase fold  51.18 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.0170464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  51.03 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  50.68 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  47.64 
 
 		 295 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  50.87 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  50.52 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  49.16 
 
 		 302 aa  265  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  48.51 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  45.78 
 
 		 384 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  47.14 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3199  magnesium chelatase accessory protein  50.87 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.825802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  45.97 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  43.89 
 
 		 303 aa  245  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  45.64 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  48.46 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  45.52 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  42.03 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 		 288 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  40.57 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1020  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0139875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.4 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  26.51 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.73 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  26.09 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.99 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  24.01 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 504 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.81 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  26.83 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  24 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  26.99 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  27.84 
 
 		 462 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1400  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  23.63 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  23.64 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4466  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.911408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.89 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  23.64 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  26.09 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.76 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  23.64 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  22.89 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  26.06 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  24.32 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  24.09 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  31.19 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>