More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4466 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4466  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
290 aa  580  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.911408  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2815  alpha/beta hydrolase superfamily protein  38.28 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0170711  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.71 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 
279 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
287 aa  86.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.35 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  30.58 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.36 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
257 aa  79  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
258 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  25.44 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.12 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  31.33 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  26.46 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  25.78 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
361 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.54 
 
 
370 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  26.98 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  28.47 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.32 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.57 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  24.91 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.94 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  28.79 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  25.08 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  24.91 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  27.86 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.41 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  28.27 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  23.99 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.56 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.94 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  28.24 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.68 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  26.33 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  23.16 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  26.21 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>