More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0221 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  71.01 
 
 		 278 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  70.76 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  70.7 
 
 		 274 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  70.76 
 
 		 291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  68.33 
 
 		 283 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  70.48 
 
 		 276 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  67.5 
 
 		 283 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  67.5 
 
 		 283 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  68.68 
 
 		 289 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  70.3 
 
 		 275 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  65.2 
 
 		 276 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  61.4 
 
 		 273 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  67.16 
 
 		 283 aa  351  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  54.95 
 
 		 288 aa  337  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  57.97 
 
 		 278 aa  333  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  57.82 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  52.03 
 
 		 283 aa  289  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  47.69 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  45.59 
 
 		 273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  47.97 
 
 		 282 aa  248  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  44.96 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  42.4 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  37.67 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.52 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  36.71 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 288 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  36.71 
 
 		 282 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 		 283 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  36.74 
 
 		 277 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  34.87 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 		 289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  37.08 
 
 		 287 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 288 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  36.69 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  34.67 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  36.59 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  36.59 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  36.59 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  36.59 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  36.59 
 
 		 288 aa  148  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 288 aa  148  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  34.56 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 289 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30.04 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 		 286 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.14 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 314 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.97 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2414  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 276 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0107597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 281 aa  99  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  28.12 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>