More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2033 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
266 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  99.62 
 
 
266 aa  554  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  98.5 
 
 
266 aa  550  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  85.66 
 
 
280 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  84.88 
 
 
258 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  84.5 
 
 
258 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  84.5 
 
 
258 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  84.11 
 
 
258 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  84.11 
 
 
258 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  80.62 
 
 
258 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  70.98 
 
 
257 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  68.36 
 
 
258 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  66.41 
 
 
259 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  64.96 
 
 
255 aa  340  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  60.78 
 
 
262 aa  338  4e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  62.45 
 
 
253 aa  322  5e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  60.08 
 
 
252 aa  315  6e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  41.29 
 
 
264 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  45.49 
 
 
259 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  42.91 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  44.67 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  42.75 
 
 
258 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  40 
 
 
258 aa  208  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  44.88 
 
 
255 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  44.88 
 
 
255 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  44.88 
 
 
255 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  41.77 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  43.5 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  43.9 
 
 
260 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  41.8 
 
 
257 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  40.17 
 
 
230 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 
264 aa  186  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 
261 aa  185  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  38.43 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  38.67 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  38.67 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  38.67 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  38.67 
 
 
254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  37.65 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  40.33 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  40.33 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  40.33 
 
 
256 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  40.33 
 
 
256 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  40.33 
 
 
256 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  38.28 
 
 
254 aa  181  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  38.28 
 
 
254 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  41.2 
 
 
267 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  38.91 
 
 
255 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  37.5 
 
 
254 aa  178  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 
254 aa  178  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  37.35 
 
 
265 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  38.65 
 
 
268 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  37.96 
 
 
311 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  38.91 
 
 
254 aa  175  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  38.64 
 
 
259 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  38.93 
 
 
255 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  36.68 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  37.31 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  36.03 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  40.18 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 
255 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
252 aa  159  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 
256 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 
253 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  38.8 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  38.8 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 
254 aa  152  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 
257 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  34.48 
 
 
256 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 
254 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.26 
 
 
264 aa  142  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  36.65 
 
 
253 aa  139  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
265 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  37.35 
 
 
260 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  36.4 
 
 
256 aa  137  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
268 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  31.46 
 
 
261 aa  122  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  31.8 
 
 
235 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.42 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  30.65 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
263 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57391  predicted protein  30.77 
 
 
306 aa  99  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209701  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.99 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.24 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  26.22 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  26.22 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.61 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4466  alpha/beta hydrolase fold protein  25.8 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.911408  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.97 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.97 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
283 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>