More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0892 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
272 aa  543  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  77.86 
 
 
272 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  45.85 
 
 
281 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
226 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.07 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
270 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
270 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.06 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.86 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
323 aa  93.2  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 
333 aa  92.4  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 
280 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.17 
 
 
372 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 
264 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.33 
 
 
261 aa  89.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
352 aa  89  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  31.82 
 
 
255 aa  89  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
315 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
361 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  28.09 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
310 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.52 
 
 
262 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.61 
 
 
369 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.46 
 
 
370 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
278 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.79 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 
289 aa  85.9  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
282 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
271 aa  85.9  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
296 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.31 
 
 
371 aa  85.5  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  35.47 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  32.94 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.33 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  33.46 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.11 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  24.49 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  25.76 
 
 
257 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  25.76 
 
 
257 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  25.76 
 
 
257 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.57 
 
 
295 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 
322 aa  82  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
340 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.82 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.89 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  30.38 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  27.27 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.89 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  31.45 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.89 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  29.37 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  27.63 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.94 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  26.97 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.09 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>