More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1465 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
289 aa  568  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 
296 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
272 aa  85.9  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  31.2 
 
 
462 aa  82  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  27.16 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  28.52 
 
 
456 aa  79  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  29.32 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 
263 aa  77  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  32.51 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  30.93 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3207  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  35.64 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.71 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  33.5 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  28.5 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  31.06 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.07 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.23 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  30.53 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  32.25 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.2 
 
 
425 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.17 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5781  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00627782  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.57 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.43 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  26.6 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  27.82 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
267 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  22.43 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  22.86 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  29.21 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  22.86 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  27.17 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  22.86 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  21.15 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  24.46 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28.63 
 
 
268 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0329  thioesterase, menaquinone synthesis protein  27.08 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0291902 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  27.34 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  25.84 
 
 
261 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.44 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>