More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3372 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
287 aa  557  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  41.67 
 
 
298 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  36.95 
 
 
404 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  36.05 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  36.82 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  36.95 
 
 
273 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  36.82 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
275 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 
290 aa  99  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  decreased coverage  0.007429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 
265 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 
273 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4874  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0356151  normal  0.0554825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3816  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.74 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
323 aa  79  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
299 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.71 
 
 
562 aa  76.3  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.4 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 
371 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 
371 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.97 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  30.86 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1237  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.145679 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  38.69 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0276  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267847  normal  0.743804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  42.72 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1210  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.58 
 
 
371 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1227  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 
352 aa  72.4  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  33.86 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  33.93 
 
 
294 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
257 aa  72  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1555  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
285 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0958412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.53 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  36.36 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  34.55 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.53 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  24.62 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.37 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.28 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  24.32 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  27.88 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.64 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  23.14 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
266 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.53 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  23.14 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  26.02 
 
 
262 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2564  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0225  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  43.18 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.47 
 
 
371 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
308 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  24.22 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>