More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3988 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  100 
 
 
258 aa  532  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  100 
 
 
258 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  100 
 
 
258 aa  532  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  71.48 
 
 
264 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  70.87 
 
 
255 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  70.47 
 
 
255 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  65.87 
 
 
256 aa  361  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  65.87 
 
 
256 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  65.87 
 
 
256 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  65.87 
 
 
256 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  64.57 
 
 
257 aa  354  8.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  63.92 
 
 
256 aa  354  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  64.31 
 
 
256 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  64.31 
 
 
256 aa  353  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  64.31 
 
 
256 aa  353  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  64.31 
 
 
256 aa  353  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  64.31 
 
 
256 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  64.31 
 
 
256 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  64.31 
 
 
256 aa  351  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  63.14 
 
 
256 aa  347  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  63.49 
 
 
261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  63.18 
 
 
259 aa  338  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  65.68 
 
 
240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  49.41 
 
 
261 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  49.4 
 
 
254 aa  248  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  47.79 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  45.6 
 
 
268 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  44.49 
 
 
268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  43.97 
 
 
264 aa  215  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  45.27 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  45.27 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  44.44 
 
 
264 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  45.11 
 
 
240 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  42.8 
 
 
264 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  43.4 
 
 
240 aa  209  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  42.8 
 
 
264 aa  208  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  43.03 
 
 
256 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  43.25 
 
 
260 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  39.3 
 
 
264 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  41.98 
 
 
255 aa  202  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  43.33 
 
 
260 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  40.78 
 
 
269 aa  201  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  37.7 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  41.94 
 
 
259 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  39.44 
 
 
273 aa  195  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  41.49 
 
 
258 aa  195  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  41.15 
 
 
253 aa  194  9e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  45.04 
 
 
255 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  42.08 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  38.46 
 
 
275 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  36.61 
 
 
255 aa  164  9e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  35.57 
 
 
255 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  34.29 
 
 
239 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  35 
 
 
263 aa  158  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  34.29 
 
 
239 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  35.11 
 
 
266 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  36.25 
 
 
259 aa  148  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  37.82 
 
 
247 aa  142  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  34.14 
 
 
254 aa  141  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  37.34 
 
 
246 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  38.02 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  38.02 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  30.04 
 
 
266 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  31.15 
 
 
240 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
266 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  30.74 
 
 
240 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
272 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
275 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  28.8 
 
 
267 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  30.74 
 
 
243 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  29.8 
 
 
243 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
253 aa  98.6  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  33.75 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  31.95 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  29.1 
 
 
237 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  27.69 
 
 
243 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  34.02 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.4 
 
 
558 aa  92.8  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  27.76 
 
 
243 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.85 
 
 
273 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  26.23 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  26.23 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  26.94 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
272 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  26.94 
 
 
243 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2815  carboxylesterase  25.31 
 
 
238 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
269 aa  78.6  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.21 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  27.98 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  21.07 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4028  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  22.93 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1165  alpha/beta hydrolase  29.71 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>