More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2364 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
352 aa  702    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  83.57 
 
 
353 aa  580  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  42.28 
 
 
277 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0276  alpha/beta hydrolase fold protein  37.54 
 
 
325 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267847  normal  0.743804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3207  alpha/beta hydrolase fold protein  36.56 
 
 
294 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
282 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
405 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
282 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 
296 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3602  Alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
306 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.183144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
310 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
278 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
272 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
284 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 
273 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2925  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.18 
 
 
298 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
272 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  30.6 
 
 
280 aa  94  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
246 aa  93.2  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 
284 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
339 aa  89.7  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.6 
 
 
315 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.6 
 
 
315 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
298 aa  89.7  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
309 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.25 
 
 
265 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
281 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.68 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
279 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
297 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30 
 
 
368 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
275 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.89 
 
 
275 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.1 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 
240 aa  84  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
323 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
297 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
263 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  25.83 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  29.12 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  28.78 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  30.77 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.19 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.59 
 
 
368 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 
453 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.77 
 
 
372 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  37.93 
 
 
562 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
279 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.25 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  30.77 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.21 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  30.18 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30.21 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.77 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.61 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.42 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3130  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  24.91 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.89 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.23 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  25.15 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.2 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  28.48 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4087  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  41.27 
 
 
556 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779957  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.37 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.56 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.92 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0519  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
300 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.18 
 
 
261 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
255 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
267 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 
288 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
285 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>