More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1114 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
405 aa  802    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  30.87 
 
 
310 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
278 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
322 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
284 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.31 
 
 
284 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
277 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
350 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
297 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
273 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
309 aa  99.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  26.25 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
279 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
279 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
275 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
308 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
276 aa  91.3  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
302 aa  91.3  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 
272 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
278 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
315 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 
277 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
296 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 
290 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 
278 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
287 aa  88.2  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 
301 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
293 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  41.23 
 
 
351 aa  86.7  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 
340 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
300 aa  86.3  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
266 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.08 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  28.44 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.92 
 
 
562 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
295 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
291 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.88 
 
 
299 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
291 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  28.72 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.2 
 
 
315 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  38.84 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.84 
 
 
281 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.2 
 
 
315 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.21 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.84 
 
 
262 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  43.64 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  26.72 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  28.24 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.86 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.89 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  40.91 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  41.82 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  25.17 
 
 
279 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  40.91 
 
 
297 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  40.91 
 
 
316 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
316 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  40.91 
 
 
297 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
264 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>